毛細管柱主要指內徑在0.1 ~0.5 mm的開口柱、微填充柱、填充毛細管柱。下面主要討論開管柱的特點。
(一)柱滲透性好：開口毛細管柱空心，柱阻小，因此有兩方面優(yōu)點:①可增加柱長(長可達300 m)，提升柱效;②可以用高載氣流速進行分析。
(二)分離效能高：毛細管柱的分離效能高有幾個原因:①無渦流擴散項,A=0;②傳質阻抗小(C小);③柱長比填充柱長得多(從幾米到幾百米)。每米塔片數(shù)一般在2000~5000,總柱效可達10°片,而一根普通填充柱柱長為2~6m,塔片數(shù)只有102片。不少樣品在填充柱上分離得不好，而用毛細管柱能獲得較滿意的分離。由于柱效高，所以對固定液選擇性的要求沒有填充柱那么苛刻。
(三)分析速度快：城其固定液膜薄而均勻，傳質交換快，一一個含有十幾種或更多組分的混合物分離，能在幾分鐘，甚至幾十秒內完成，比填充柱快得多。
(四)操作條件嚴：毛細管的柱容很小，僅有幾毫升，因此要求進樣量非常微小，對儀器結構、性能的要求更為嚴格。
(五)應用范圍廣：毛細管色譜具有效能高、快速等特點，其應用范圍涉及許多學科和領域。隨著科技的進步，人類生活水平的提高，人們更加關心生態(tài)平衡、環(huán)境保護和人類健康，在解決此類課題中，毛細管色譜將發(fā)揮巨大作用。
